财政部副部长许宏才表示，财政部、国税总局将从以下几个方面做好工作：
第一，建立政策落实的协调工作机制。财政部、国税总局及相关部门定期会商，我们在这之前已经会商了多次，发布相关的政策文件解读等。根据增值税留抵退税退付情况，还有其他一些退税减税降费政策的实施情况，及时发现并妥善处置出现的问题，完善管理制度，防范企业虚开增值税发票骗取退税等，还指导地方比照中央的做法，建立工作协调机制。
第二，压实省级主管部门的主体责任。要求各地抓紧制定细化到区县的增值税留抵退税的政策方案，重点保障小微企业留抵退税和县区退税资金的需要。对于留抵退税规模占财力比重比较高的县区，省级财政部门在分配专项资金的时候，应该予以认真考虑，逐个制定针对性的方案，做到补助资金与留抵退税的规模相匹配，确保退税资金及时退付。
第三，严格规范实施有效管理。明确相关转移支付分配备案、预算下达、资金调拨等管理的要求，并督促执行，完善政府收支分类科目并且有效执行，做到留抵退税政策可细化、可统计、可分析，将专项资金纳入财政直达资金的范围，实行动态监控，防止闲置挪用。专项资金实行单独拨付，并且保障地方国库动态存有半个月的退税所需资金。因为税要退出去，库里必须要有钱，没有钱就会影响退税的进度，也影响政策的落实，所以资金方面必须保证好。
第四，严肃财经纪律。专项资金不得用于建设政府性楼堂馆所，不得用于建设各类形象工程、政绩工程，不得用于土地储备和棚户区改造新开工项目等支出。防范虚列留抵退税等方式骗取中央财政补助资金，以及征收过头税费、虚增财政收入等行为。在严肃财经纪律方面也有一些针对性的措施。